什么是 ITS 測序？ITS1 與 ITS2 選哪個(gè)好？

ITS 測序含義：ITS 是 internal transcribed spacer 的縮寫(xiě)，內部轉錄間隔區。

真核生物 rRNA 順?lè )醋幼鳛橐粋€(gè)轉錄單元，包含 18S、5.8S 和 28S rRNA。轉錄后的剪接加工過(guò)程，會(huì )移除兩個(gè)內部轉錄間隔區和 5.8SrRNA ，這兩個(gè)內部轉錄間隔區和 5.8SrRNA 統稱(chēng)為 ITS 區。通常 18S rRN是作為真核生物分子鑒定的標準，但是 ITS 區在真菌分類(lèi)里更加準確，要優(yōu)于使用 18SrRNA作為標準得到的結果。

ITS1 和 ITS2 作為非編碼區，承受的選擇壓力較小，相對變化較大，并且能夠提供詳盡的系統學(xué)分析所需要的可遺傳性狀。最近的研究發(fā)現，ITS1 比 ITS2 效率更高、引物適用性更普遍和廣泛，此外 ITS1 的擴增片段更短、GC 含量更低，因此 ITS1 可能更優(yōu)于 ITS2。