活動(dòng)日程
百邁客三代測序 服務(wù)再創(chuàng )輝煌
HiFi模式由于其長(cháng)讀長(cháng)、高準確性等特點(diǎn)，已在多個(gè)研究方向有大量的應用?；赑acBio Revio測序平臺，百邁客將繼續在動(dòng)植物基因組測序、全長(cháng)轉錄組測序、微生物真細菌測序、宏基因組研究、甲基化研究、結構變異、微生物擴增子全長(cháng)等方向提供優(yōu)質(zhì)的服務(wù)，未來(lái)也將在單細胞轉錄組的領(lǐng)域上“大展拳腳”。
PacBio?Revio HiFi數據應用方向
基因組（Denovo Sequencing），即基因組從頭測序，指在不依賴(lài)參考基因組的情況下繪制該物種的全基因組序列圖譜，從而獲取該物種的全部遺傳信息。在已知基因組大小，或者有調研圖結果的情況下，基于PacBio?Revio測序平臺進(jìn)行測序，進(jìn)行基因組組裝和基本分析，獲得高質(zhì)量基因組序列，為該物種的后基因組學(xué)、分子育種、環(huán)境適應等方面研究奠定基礎。并且，隨著(zhù)對基因組更高質(zhì)量的追求，單一材料的基因組無(wú)法涵蓋該物種的所有遺傳信息等，對泛基因組、T2T基因組、單倍型基因組的構建也越來(lái)越成為基因組研究的熱點(diǎn)！
全基因組重測序（Resequencing）是對已知基因組序列的物種進(jìn)行不同個(gè)體的二代或三代基因組測序，并在此基礎上對個(gè)體或者群體進(jìn)行變異檢測分析。結構變異（SVs）指長(cháng)度大于50bp的大片段結構變異，包括許多類(lèi)型，如缺失（DEL）、插入（INS）、重復（DUP）和倒位（INV）等，它們在個(gè)體和群體水平上促進(jìn)了人類(lèi)、動(dòng)植物基因組的多樣性和進(jìn)化。并且越來(lái)越多的證據表明，SVs與許多動(dòng)植物農藝性狀（如抗病性、產(chǎn)量性狀等）及人類(lèi)疾?。ㄈ缟窠?jīng)發(fā)育疾病、心血管疾病和癌癥等）相關(guān)。相較于二代測序，基于PacBio Revio三代測序可以提高SVs檢測的靈敏度，提供了豐富的變異信息，并且，PacBio Revio通量更高，成本更低，能夠更全面地從群體層面理解遺傳變異及其與人類(lèi)疾病/動(dòng)植物表型之間的關(guān)系。
隨著(zhù)高通量測序的發(fā)展，轉錄組測序（RNA-seq）已經(jīng)成為研究基因表達調控的主要手段。二代測序技術(shù)通量高，更多的關(guān)注基因表達量，然而其局限性在于測序讀長(cháng)短，轉錄本產(chǎn)生拼接錯誤，導致轉錄本結構不完整。而生物體內復雜多變的轉錄本是調節基因表達和蛋白質(zhì)多樣性的重要機制，準確鑒定轉錄本結構，是深入研究基因表達調控模式的基礎?？刹捎?strong>PacBio Revio測序平臺，借助其長(cháng)讀長(cháng)優(yōu)勢，無(wú)需組裝，直接獲得全長(cháng)轉錄本。
宏基因組學(xué)（Metagenomics）是對環(huán)境樣本中（土壤、糞便等）微生物總DNA進(jìn)行測序。關(guān)注環(huán)境微生物群體種群結構、進(jìn)化分析、功能基因；解析微生物功能與環(huán)境之間的關(guān)系；挖掘和研究特定功能基因及代謝通路?；?strong>PacBio Revio測序能夠對環(huán)境樣本進(jìn)行微生物組分析，組裝重復的基因組區域、提供宏基因組物種鑒定的準確度、獲得更多低豐度物種。另外，基于PacBio Revio進(jìn)行全長(cháng)微生物多樣性測序技術(shù)，兼顧了長(cháng)讀長(cháng)和準確性高的優(yōu)勢，可直接獲得真正準確到“種”的分類(lèi)鑒定，可以更加真實(shí)地還原樣本中微生物的群落結構。
表觀(guān)遺傳學(xué)（Epigenetics）是指基于非基因序列改變所致基因表達水平的改變。DNA甲基化是表觀(guān)遺傳的經(jīng)典修飾方式，在調控基因表達、維持染色質(zhì)結構、基因印記、X染色體失活以及胚胎發(fā)育等生物學(xué)過(guò)程中發(fā)揮著(zhù)重大的作用。DNA甲基化的形式多樣，主要包括C5-甲基胞嘧啶（5mC）、N6-甲基腺嘌呤（6mA）等。目前市場(chǎng)常用重亞硫酸鹽法檢測5mC，其準確度高，但化學(xué)處理會(huì )導致DNA分子的片段化、測序深度高、無(wú)法鑒定更多修飾類(lèi)型?；?strong>PacBio Revio測序平臺可在不依賴(lài)DNA實(shí)驗處理的情況下，根據信號差來(lái)識別甲基化位點(diǎn)信息。
百邁客青島實(shí)驗室中現已有十余臺PacBio?測序儀，結合Revio的引進(jìn)和使用，百邁客將進(jìn)一步提升三代測序服務(wù)產(chǎn)品，致力于提供全面而可靠的服務(wù)。讓我們一起期待！
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