受不同物種影響。
LD是不同基因座上等位基因非隨機組合。但LD隨世代的增加、重組次數的增加而不斷下降。所以,那些繁殖力強、時(shí)代間隔短的物種(例如,昆蟲(chóng)),其LD衰減的速度是非??斓?;同一物種,不同群體類(lèi)型,由于其遺傳背景不同,LD衰減速度也存在很大的差異。馴化群體,群體遺傳多樣性下降,位點(diǎn)間的相關(guān)性(連鎖程度)加強。所以,馴化程度越高,選擇強度越大的群體,LD衰減速越慢。同樣,自然選擇、遺傳漂變導致的群體遺傳多樣性下降,也會(huì )減慢LD衰減的速度;染色體在不同位置的LD衰減距離是不同的。通常著(zhù)絲粒區更難重組,所以L(fǎng)D衰減更慢,而基因組上那些受選擇的區域相比普通的區域,LD衰減速度也是更慢的,因此分析結果提供了各個(gè)染色體獨立的LD分析結果。