年度盤(pán)點(diǎn)|2022年百邁客單細胞&空間組學(xué)扶搖直上

白駒過(guò)隙,時(shí)光荏苒。2022年百邁客突破國外技術(shù)壟斷，推出百創(chuàng )系列產(chǎn)品，提供植物單細胞測序新方案，打造單細胞&空間個(gè)性化交互式分析，成功助力蝴蝶蘭花器官時(shí)空圖譜國內首秀，積累了豐富的項目經(jīng)驗。接下來(lái)，讓我們一起來(lái)看看今年百邁客在單細胞&空間組學(xué)上有哪些突破。

百創(chuàng )智造，破界而出

百創(chuàng )DG1000突破直徑壁壘：為了突破單細胞試劑耗材及儀器長(cháng)期以來(lái)的國外技術(shù)壟斷，降低單細胞應用的成本，突破主流平臺40μm細胞直徑限制，滿(mǎn)足更多的單細胞場(chǎng)景需求。經(jīng)過(guò)潛心研發(fā)，百邁客發(fā)布了自主研發(fā)的單細胞微液滴系統-百創(chuàng )DG1000。

百創(chuàng )S1000亞細胞級分辨率：今年由百創(chuàng )智造推出亞細胞級別空間轉錄組測序技術(shù)，不僅打破了國外芯片技術(shù)的壟斷，還突破了分辨率和檢測通量的局限，支持100μm ~5μm多級分辨率分析。成為“亞細胞級分辨率”和“微孔”結合的原位捕獲空間轉錄組測序技術(shù)，全面邁入國產(chǎn)化空間轉錄組的亞細胞技術(shù)時(shí)代。

百創(chuàng )S1000-Nanopore空間全長(cháng)轉錄組：今年百創(chuàng )智造發(fā)布了百創(chuàng )S1000-Nanopore空間全長(cháng)轉錄組產(chǎn)品。經(jīng)過(guò)不斷研發(fā)測試，百創(chuàng )S1000不僅解決了分辨率低、成本高等難題，其獨立設計的SpatialBarcode還可以高度適配ONT平臺，獲得的有效數據量得到了大幅提高，為廣大科研人員和臨床工作者開(kāi)展發(fā)育、腫瘤、免疫、神經(jīng)等一系列研究和應用提供了新思路。

多種方案，隨心挑選

百邁客植物單細胞核轉錄組技術(shù)（snRNA-seq），無(wú)需進(jìn)行原生質(zhì)體的制備，在保證高效捕獲分選單細胞核轉錄組數據的同時(shí)，減少了應激基因表達影響、胞質(zhì)內代謝物的干擾，并可兼容更大細胞直徑，獲得更全面信息。也為特殊樣本進(jìn)行單細胞測序提供了新的解決方案，為進(jìn)一步推動(dòng)植物單細胞研究提供重要的技術(shù)支撐。

個(gè)性化云交互，自主探索更多可能

百邁客研發(fā)團隊全力打造的單細胞&空間轉錄組個(gè)性化交互平臺，專(zhuān)為解決廣大客戶(hù)的個(gè)性化分析問(wèn)題而生，分析參數隨心更改、分析不限次數，省時(shí)省力，高效完成交互式分析。

單細胞個(gè)性化交互云平臺

可自主進(jìn)行細胞過(guò)濾、細胞聚類(lèi)、maker基因分析、細胞注釋、差異分析等交互式分析。

空間轉錄組交互式云平臺

可自主進(jìn)行spot數據過(guò)濾、多樣本整合分析、降維聚類(lèi)分析、基于目標區域的差異基因分析等步驟。

交互式軟件，便于可視化分析

百邁客自主研發(fā)的多級分辨率可視化工具–Spatial Tools，該工具可以進(jìn)行自定義展示HE圖、全局聚類(lèi)圖、目標cluster聚類(lèi)圖、單細胞聯(lián)合空間細胞類(lèi)型注釋分布圖。針對感興趣的區域，可以使用選框或套索工具獲取目標區域的barcode列表，自定義配色、透明度、標題、圖例調整等，分析內容更加貼近實(shí)際所需，交互式功能十分強大。

助力蝴蝶蘭時(shí)空圖譜國內首秀

影響因子：19.160

發(fā)表單位：復旦大學(xué)與江西農業(yè)大學(xué)

百邁客提供服務(wù)：10x Visium空間轉錄組技術(shù)

研究?jì)热荩豪?0x Visium空間轉錄組學(xué)數據分析了蝴蝶蘭花器官早期發(fā)育過(guò)程中基因表達的動(dòng)態(tài)變化。通過(guò)對時(shí)空表達分布的比較，確定了在特定組織/階段優(yōu)先表達的數千個(gè)基因，包括MADS-box基因和許多其他潛在下游基因，形成了花器官初始化、身份決定和形態(tài)建成的模型。對蘭花開(kāi)花發(fā)育過(guò)程進(jìn)行了系統的研究，為進(jìn)一步研究蘭花開(kāi)花過(guò)程中復雜而重要的基因調控網(wǎng)絡(luò )提供了寶貴的資源。

百邁客項目經(jīng)驗分享

?目前百邁客單細胞轉錄組已完成動(dòng)植物物種50+類(lèi)，組織類(lèi)型250+種?？臻g轉錄組已在100余種不同物種組織類(lèi)型中得到驗證，突破了軟骨、血管、皮膚、花苞、幼芽等疑難樣本切片透化的難點(diǎn)攻克，積累了豐富的項目經(jīng)驗。

尾聲

凡是過(guò)往，皆為序章。直掛云帆，乘風(fēng)破浪。2023我們將砥礪前行，共話(huà)新篇章!