研究背景
文中以馬齒莧葉片為研究對象,在空間層面整合了光合作用中C4及CAM(Crassulacean acid metabolism,景天酸代謝)兩種不同代謝途徑的細胞定位。對于大部分植物,其光合代謝往往只涉及到上述一種途徑。馬齒莧是一種特殊的C4草本植物,在干旱脅迫下,亦可進(jìn)行CAM。
對馬齒莧葉片在水分充足和干旱條件下的葉肉和束鞘細胞群體進(jìn)行了兩種不同的空間基因表達分析,此外,測試了在多種情況下,C4和CAM在葉肉和束鞘細胞間整合的最有效生化模型,作為一個(gè)新的理論闡釋馬齒莧植物光合代謝機制。
研究方法
實(shí)驗材料:馬齒莧葉片,水分充足葉片vs 干旱誘導葉片,3個(gè)不同區域,
實(shí)驗方法:空間轉錄組(10x visium) ,單細胞測序(LCM-seq)

馬齒莧葉片干旱誘導CAM和激光捕獲顯微解剖
研究結論
1. 研究人員通過(guò)激光顯微技術(shù)對不同環(huán)境(水分充足及干旱環(huán)境,白天及夜間)葉片進(jìn)行切割區分,獲得葉肉,葉鞘及水分貯藏細胞,進(jìn)行傳統的轉錄組分析,并結合空間轉錄組測序及葉片的組織區分,分析了C4及CAM相關(guān)的差異表達基因,并建立了流量平衡模型,預測了干旱條件下c4 +CAM系統的完整性。
2. 在馬齒莧中,C4和CAM途徑與合成PEP相關(guān)的基因均在葉片中富集,而卡爾文循環(huán)相關(guān)基因只富集在葉鞘細胞中,表明馬齒筧的CAM途徑,不僅存在晝夜分離,也存在著(zhù)空間的分離。糖運輸的增加與CAM誘導有關(guān),G3P起源于束鞘,但PEP再生的最后步驟主要發(fā)生在葉肉中。CAM和c4固碳發(fā)生在相同的細胞中,CAM產(chǎn)生的代謝產(chǎn)物可能直接融入到C4循環(huán)中。
3. 作者建立了雙細胞-雙(晝夜)階段的光合代謝模型。當水分充足時(shí),馬齒筧葉片中只能檢測到少量的CAM途徑。而處于干旱環(huán)境時(shí),可以進(jìn)行C4+CAM代謝途徑,此時(shí)馬齒筧中的C4途徑亦可利用CAM途徑產(chǎn)生的蘋(píng)果酸,大幅提高光合作用的效率。這一發(fā)現對C4 +CAM光合作用的空間明確描述,為作物改良提供了新的藍圖。

馬齒莧干旱脅迫下不同空間區域基因表達特征