攜三代測序和生物云平臺為疫情抗擊免費提供技術(shù)支持,百邁客在行動(dòng)!
新型冠狀病毒疫情對我國人民的生產(chǎn)生活產(chǎn)生了較大影響,牽動(dòng)著(zhù)大家的心。舉國上下都十分重視,我們的一線(xiàn)醫護人員沖在了抗擊疫情的最前線(xiàn),大家也都從各方面提供著(zhù)各種援助,充分體現了我們一方有難八方支援的優(yōu)良傳統。
作為一種新型冠狀病毒,我們對它的了解還不夠,我們的臨床科學(xué)家們也在想盡各種辦法加班加點(diǎn)研究這種新型冠狀病毒,以便盡快研究清楚它的生物學(xué)分子機理,正如1月26日,在國務(wù)院新聞辦疫情新聞發(fā)布會(huì )上,中國疾病預防控制中心主任高福院士表示的,要結合多種技術(shù)手段來(lái)幫助做病毒的解析。百邁客作為三代測序和生物云服務(wù)提供商,結合自身的技術(shù)特點(diǎn),也積極的參與到抗擊疫情的戰斗中,用自己的技術(shù)為抗擊疫情貢獻一份力量。
針對此次疫情,百邁客積極與一線(xiàn)的醫護和科研人員合作,結合一線(xiàn)的需求,積極調動(dòng)各種資源,經(jīng)過(guò)十幾天夜以繼日的開(kāi)發(fā),終于把第一版新型冠狀病毒(nCov)基因組數據庫分析平臺上線(xiàn),為我們的一線(xiàn)科研人員提供免費服務(wù)?,F把階段性開(kāi)發(fā)進(jìn)展和支持方式公布如下,希望對加快破解和管控疫情提供有效支撐:
1、?“病毒數據庫&自動(dòng)化分析平臺/工具” 向社會(huì )免費共享
自2019年12月疫情首現以來(lái),百邁客研發(fā)團隊及時(shí)跟進(jìn)疫情研究進(jìn)展。目前已完成一期研發(fā)計劃,我們通過(guò)對各數據庫中的新型冠狀病毒數據進(jìn)行合理整合分析,及時(shí)搭建了“新型冠狀病毒數據庫分析平臺”(http://ncovdb.biocloud.net/home) ,本數據庫于2020年1月27日20:00時(shí)正式上線(xiàn)。本數據庫將配合國家公共資源數據庫為社會(huì )提供更全面、及時(shí)、準確的數據資源。
數據庫部署了31個(gè)新型冠狀病毒基因組序列,其中MN938384、MN908947、MN975262等菌株均已補充詳細的基因組、編碼基因及蛋白序列信息,我們還基于這31個(gè)菌株,2株MERS作為外源構建了物種進(jìn)化樹(shù),以便更清晰解讀新型冠狀病毒的進(jìn)化樹(shù)起源。研究人員可便捷下載基因組數據資源,亦可通過(guò)我們部署的Blast、GBrowse、Primer Design 等工具完成相關(guān)的初步數據分析、挖掘。
我們將持續跟進(jìn)、并更新該數據庫,為國內外科研工作者提供方便快捷的數據檢索及下載服務(wù)。在隨后的二期、三期研究計劃中,我們會(huì )繼續部署各種自動(dòng)化分析工具,分析保守域、菌株間的變異信息,尋找菌株間的共性的突變信息,為病毒致病機理的研究、疫苗的開(kāi)發(fā)等提供技術(shù)支持。
2、三代納米孔技術(shù)助力病毒變異監測
三代測序技術(shù)作為基因組學(xué)研究的新興技術(shù),對病毒的組學(xué)研究有著(zhù)重要作用,作為三代測序技術(shù)服務(wù)提供商,百邁客生物與戰略合作伙伴Oxford Nanopore公司聯(lián)合協(xié)調了5套MinION測序平臺及配套試劑盒,各位疫情防控專(zhuān)家如有需求,聯(lián)系評估后隨時(shí)無(wú)償配發(fā),保證前線(xiàn)專(zhuān)家做好對疫情的實(shí)時(shí)監控、及時(shí)分析;如有建好的2019-nCov病毒測序文庫也可以結合送樣要求,聯(lián)系我們。
附錄:樣品要求
3、已配備專(zhuān)業(yè)生物信息分析團隊,并向社會(huì )無(wú)償提供信息分析技術(shù)支持
疫情爆發(fā)以來(lái),我們組織20余人的生信分析團隊提前結束假期,不斷針對發(fā)布的病毒基因組進(jìn)行研究分析,隨時(shí)待命加入抗擊疫情的隊伍。同時(shí),百邁客亦誠懇邀請、歡迎各位專(zhuān)家學(xué)者共同探討疫情防控良策,請聯(lián)系18514282648(微信同號)進(jìn)群討論。
4、其它可調配資源
如果前線(xiàn)專(zhuān)家需要其它生物技術(shù)支持資源,百邁客生物將不遺余力提供最大的幫助。
24小時(shí)對接聯(lián)系人:
I.數據庫使用&數據分析對接人:王老師
手機:18514282648(同微信)郵箱:wangf@biomarker.com.cn
II.樣品準備&測序對接人:康老師
手機:16622926288(同微信)郵箱:kangjm@biomarker.com.cn
我們將全力協(xié)調公司各種資源,在基因組變異與進(jìn)化,病毒感染與致病機理分析,病毒溯源等方面為國為民貢獻一份“微薄”之力,在生命的賽道上,分秒必爭!疫情防控無(wú)小事,從你我做起。