全基因組重測序生物信息分析培訓班

想系統學(xué)習全基因組重測序常規分析方法，想了解重測序在實(shí)踐中的應用，請報名百邁客生物全基因組重測序生物信息分析培訓班。

應各位老師需求，百邁客特開(kāi)辦重測序生信課程，面向全體科研工作者，系統學(xué)習全基因組重測序中常規分析內容。課程設計覆蓋數據質(zhì)控、序列比對、SNP Calling、SNP 注釋、結構變異等重測序常見(jiàn)分析內容。

課程亮點(diǎn)：

1、豐富齊全的學(xué)習文檔，每一步驟每一代碼詳細列出

2、課上課下均可獨立操作的專(zhuān)門(mén)服務(wù)器

3、理論與實(shí)操相結合，系統學(xué)習遺傳進(jìn)化課程

4、免費且長(cháng)期的售后答疑群，保障學(xué)員課下學(xué)習

5、講師團隊專(zhuān)注于動(dòng)植物領(lǐng)域5年以上，具有豐富的項目經(jīng)驗和培訓經(jīng)驗

為了讓大家更系統了解本次培訓班的相關(guān)內容，現將部分教授內容展示如下：

數據質(zhì)控

測序數據的質(zhì)量直接決定了數據分析的質(zhì)量及可靠性。低質(zhì)量的測序數據往往導致分析結果出現異?；蛘叻治鼋Y果中包含過(guò)多的假陽(yáng)性假陰性結果。利用FastQC可以快速實(shí)現對大量測序數據的質(zhì)量評估并生成分析結果報告。分析的指標完善，同時(shí)可以生成可視化的圖形報告，數據質(zhì)量結果一目了然。

SNP?Calling

GATK全稱(chēng)是The Genome Analysis Toolkit，是Broad Institute（The Broad Institute, formerly the Broad Institute of MIT and Harvard, evolved from a decade of research collaborations among MIT and Harvard scientists.）開(kāi)發(fā)的用于二代重測序數據分析的一款軟件，里面包含了很多有用的工具，主要注重與變異的查找，基因分型且對于數據質(zhì)量保證高度重視。GATK是目前業(yè)內使用較廣的基因數據變異檢測工具。本次課程基于GATK的Best?Practices，實(shí)現從原始的比對結果開(kāi)始，到最終的高質(zhì)量突變位點(diǎn)的完整信息分析流程。

SNP?注釋

SnpEff 軟件通過(guò)基因組結構注釋數據（GTF/GFF文件），對VCF文件中的SNP/InDel信息進(jìn)行注釋?zhuān)粗饕忉屃薙NP/InDel是否能夠對編碼蛋白基因造成影響。SnpEff自帶大量已經(jīng)發(fā)表的基因組的信息，可以快速利用已發(fā)表的基因組信息進(jìn)行SNP/InDel位點(diǎn)的注釋分析。對于未收錄的基因組，SnpEff也提供了標準流程來(lái)構建對應的分析數據庫。

結構變異

高通量測序數據除了可以分析SNP/InDel位點(diǎn)外，還可以利用雙端測序的中的插入片段長(cháng)度信息和比對時(shí)出現的異常比對結果，對測序樣本中可能存在的結構變異進(jìn)行分析。本次課程主要利用BreakDancer這款軟件進(jìn)行結構變異位點(diǎn)的分析，軟件主要預測了五種類(lèi)型的結構變異：插入、缺失、倒位、染色體間和染色體內易位，

課程內容列表

購課方式：（會(huì )員卡及單獨購買(mǎi)課程選擇即可）

若購買(mǎi)多個(gè)生信課程，我們還有會(huì )員卡制優(yōu)惠：

普通會(huì )員：任選4個(gè)生信課程，6000元/年

銀牌會(huì )員：任選6個(gè)生信課程，8000元/年

金牌會(huì )員：任選10個(gè)生信課程，11000元/年

鉑金會(huì )員：任選13個(gè)生信課程，13000元/年

會(huì )員權益：
1、包含云收費視頻包：百邁客云課堂現有價(jià)值近6千的收費課程免費看（除以上生信課程外）
2、不限次直播課程：所選課程對應1年的直播觀(guān)看權限，觀(guān)看直播不限次
3、線(xiàn)下活動(dòng)：會(huì )員線(xiàn)下活動(dòng)每年至少一次，活動(dòng)不僅有專(zhuān)家、有美食、有美酒同時(shí)還有美景與技術(shù)牛
4、金牌、鉑金會(huì )員另贈送百邁客第八屆全國功能基因組學(xué)峰會(huì )門(mén)票（峰會(huì )為>500人會(huì )議，現已舉辦7屆，每屆均有院士大牛參加）
5、收費工具免費用：生信課程中同樣分析可選擇代碼或在線(xiàn)工具實(shí)現，其中收費在線(xiàn)工具可有3個(gè)月免費使用權
6、購課折扣：超過(guò)會(huì )員卡內的課程，每增加一個(gè)可享7折優(yōu)惠