百邁客云隆重向大家介紹-交互式分析繪圖功能！數據可視化是數據分析重要環(huán)節！隨著(zhù)研究的不斷深入，分析靜態(tài)圖不能滿(mǎn)足客戶(hù)的需求。為此，百邁客云近年陸續推出了多款APP的可視化交互功能，涵蓋單細胞、轉錄組、微生物組及代謝與多組學(xué)等，進(jìn)一步為科研提效！快來(lái)體驗！新客戶(hù)可以搜索“百邁客云”，按如下步驟注冊免費體驗哦：
下面將對這些功能的應用場(chǎng)景進(jìn)行逐一介紹(配有GIF動(dòng)圖)：
百邁客單細胞轉錄組線(xiàn)上分析擁有30+種基本分析，20+種個(gè)性化分析，空間轉錄組擁有近20種基本分析，近20種個(gè)性化分析。在這里，展示4款交互式個(gè)性化：
1.1、細胞聚類(lèi)交互圖
篩選到有效細胞后，可以基于細胞的基因表達矩陣，進(jìn)行細胞聚類(lèi)分析。細胞聚類(lèi)交互圖可展示UMAP/TSNE圖，調整點(diǎn)的大小，點(diǎn)配色，文字等交互圖樣式可自定義，具體見(jiàn)下圖及圖中的描述。
圖1.1?單細胞_胞聚類(lèi)交互圖
1.2、基金檢索交互
做完細胞聚類(lèi)cluster之間的差異基因分析，可快速通過(guò)基因分布圖，小提琴圖，點(diǎn)圖查看基因在各個(gè)cluster的表達情況，還可實(shí)現手動(dòng)注釋cluster。
圖1.2 單細胞_基因檢索交互結果圖
做完細胞聚類(lèi)cluster之間的差異基因分析后，可通過(guò)火山圖查看基因的表達情況?？刹榭椿鹕綀D中點(diǎn)對應的基因，樣式可自定義。
圖1.3 單細胞_火山圖交互
1.4、ROI交互分析
空間轉錄組的客戶(hù)，可根據組織聚類(lèi)圖，結合影像學(xué)和研究目的，自主選擇感興趣區域（ROI，region of interesting），查看區域之間的基因表達情況，從而獲得更典型的對比結果。
圖1.4 空間_ROI交互分析
2.1、韋恩圖交互
通常會(huì )對差異的基因/物質(zhì)做簡(jiǎn)單的韋恩圖繪制，也可以對總體的基因/物質(zhì)進(jìn)行繪圖。交互韋恩圖的功能非常靈活，2-5個(gè)分組自動(dòng)繪制韋恩圖，5-32個(gè)自動(dòng)為花瓣圖，支持經(jīng)典韋恩圖、齒輪圖的更換，還支持數字點(diǎn)擊進(jìn)行下級數據的二次篩選交互。
圖2.1 交互式韋恩圖
2.2、交互式火山圖
火山圖（Volcano Plot）可以快速地查看基因/物質(zhì)在兩個(gè)（組）樣品中表達水平的差異?；鹕綀D的交互式支持自定義展示一定數目的重點(diǎn)差異基因，還支持支持選擇重點(diǎn)差異基因進(jìn)行數據篩選，進(jìn)行二次數據處理。
圖2.2 交互式火山圖
2.3、交互式氣泡圖
氣泡圖是富集分析后的重要展示手段，交互氣泡圖常用于GO和KEGG氣泡圖，支持Pvalue/Qvalue以及rich_factor/GeneRatio的自由切換，支持圖片選擇重點(diǎn)富集通路進(jìn)行數據篩選，進(jìn)行二次數據處理。
圖2.3 交互式氣泡圖
2.4、交互式網(wǎng)絡(luò )圖
網(wǎng)絡(luò )圖也是獲取差異基因/物質(zhì)后的重要分析方法，如：蛋白互作圖，該交互功能主要包括以下幾點(diǎn)：
1、可對的節點(diǎn)和連線(xiàn)進(jìn)行顏色、形狀、大小的調整
2、支持篩選重點(diǎn)基因之間的子網(wǎng)絡(luò )和相關(guān)網(wǎng)絡(luò )
3、可改變網(wǎng)絡(luò )圖的布局，包括對稱(chēng)、居中、環(huán)形等
4、支持點(diǎn)擊圖片進(jìn)行數據的二次篩選，循環(huán)進(jìn)行數據繪圖
圖2.4 交互式網(wǎng)絡(luò )圖
3.1、物種分布交互圖
在獲取完物種注釋信息后，物種分布圖常常是常用、直觀(guān)的一直展示方式。交互圖支持自定義樣式、自定義坐標、自定義排序、隱藏物種等。
圖3.1 微生物_物種分布圖
3.2、Alpha多樣性箱線(xiàn)交互圖
Alpha多樣性用來(lái)反映單個(gè)樣本的物種豐富度和多樣性，可同時(shí)做組間差異分析，支持全圖自定義、線(xiàn)圖/小提琴圖切換、差異p值或*的體現等。
圖3.2 Alpha多樣性箱線(xiàn)交互圖
3.3、Beta多樣性降維聚類(lèi)圖
Beta多樣性主要用來(lái)反映樣本間的物種多樣性相似情況，在獲得Beta多樣性距離矩陣后，就可以用多種降維聚類(lèi)方式進(jìn)行自定義圖形化展示。除常規交互外，還可自定義是否添加置信橢圓、組間連線(xiàn)。
圖3.3 Beta多樣性PCA圖
4.1、交互式柱狀圖小工具
一次繪圖，多圖自由轉換。排列柱狀圖、堆疊柱狀圖、排列點(diǎn)線(xiàn)圖、堆疊點(diǎn)線(xiàn)圖、3D柱狀圖等互相自由切換。同時(shí)，只需點(diǎn)擊下legend圖例，即可取消掉過(guò)多的展示項，從而達到重新繪制的目的。滾動(dòng)下鼠標，即可隱藏過(guò)多的樣品展示。
圖4.1 (a)和(b) 小工具_交互式柱狀圖動(dòng)態(tài)展示
4.2、交互式箱線(xiàn)圖小工具
類(lèi)同于柱狀圖的交互效果，還支持轉換為小提琴圖，鼠標懸空放置，顯示箱線(xiàn)圖最大值、最小值、中位值，兩個(gè)四分位數等指標數值。
圖4.2 小工具_交互式箱線(xiàn)圖動(dòng)態(tài)展示
4.3、交互式聚類(lèi)熱圖小工具
傳統聚類(lèi)圖常用的參數均支持(如：橫列是否聚類(lèi)等)，同時(shí)鼠標懸空放置單元格上會(huì )顯示對應的源數據信息，還支持相關(guān)性熱圖繪制。
圖4.3 小工具_交互式聚類(lèi)熱圖動(dòng)態(tài)展示
4.4、交互式散點(diǎn)圖
除常用的交互功能外，還支持切換為氣泡圖、曼哈頓圖、3D散點(diǎn)圖，組別支持置信橢圓繪制。
圖4.4 小工具_交互式散點(diǎn)圖
京公網(wǎng)安備 11011302003368號