近日，《自然》雜志推出2022值得年度關(guān)注的榜單技術(shù)，其中空間多組學(xué)技術(shù)就榜上有名，該技術(shù)不僅在2020年被Nature Methods評為年度技術(shù)方法，同樣在2021年大量科學(xué)先后報道了空間多組學(xué)技術(shù)在不同領(lǐng)域重大突破和發(fā)現，再次在2022年被評為值得關(guān)注的7大年度技術(shù)之一。我們不僅感嘆空間轉錄組測序技術(shù)的強大，這里就不得不回顧一下在過(guò)去的一年中空間轉錄組測序技術(shù)的應用和發(fā)展。
2022年值得關(guān)注的7大技術(shù)榜單
2021年利用空間轉錄組測序技術(shù)發(fā)文章呈現井噴式增長(cháng)，其中已正式發(fā)表文章有40余篇，而空間轉錄組學(xué)為特色的預印本bioRxiv搜索“空間轉錄組學(xué)（spatial transcriptomics）”一詞，獲得了500余條結果，其中80余條是在2021年提交的，可以說(shuō)2021年是空間轉錄組測序技術(shù)應用好文發(fā)表突飛猛進(jìn)的一年。
2016年-2021年空間轉錄組文章發(fā)表趨勢和影響因子分布
通過(guò)檢索空間轉錄組發(fā)表文章的數據分析來(lái)看，該技術(shù)在2021年中得到廣泛應用，并且文章影響因子主要集中在10~20分區間，其占比高達39%，其次在30分以上占比達到30%，由此可見(jiàn)空間轉錄組測序技術(shù)的應用極大提升了文章的質(zhì)量和檔次。
不僅如此，2021年空間轉錄組測序技術(shù)還在物種上有了新的突破，不再局限于人和鼠常見(jiàn)的模式物種，已經(jīng)開(kāi)始邁入哺乳動(dòng)物（豬）、家禽類(lèi)（雞）、植物類(lèi)（擬南芥、云杉、楊樹(shù)）等新的物種領(lǐng)域，極大拓展其應用范圍。
物種空間轉錄組文獻發(fā)表統計
2021年空間轉錄組在不同組織部位上應用也取得一些新進(jìn)展：比如骨組織一類(lèi)就有不少文章發(fā)表，有頭蓋骨[PNAS，IF=11.2]、腰骨骼肌[NatureCommunications，IF=14.9]、肩部肌腱[AnnRheum Dis，IF=19.1 ]；生殖器官有子宮內膜[Nat Genet，IF=27.6]、卵巢[NatureBiotechnology，IF=54.9]；泌尿系統：前列腺[Nature Communications，IF=14.9]、膀胱[NatureCommunications，IF=14.9]；腸道組織：胎兒腸道[Cell，IF=41.6]；脂肪組織：皮下腹部[CellMetabolism，IF=27.3]；腦組織：腦內炎癥[[Ann Rheum Dis，IF=19.1 ]，IF=24.9]、等皮質(zhì)和海馬[Cell，IF=41.6]、腦神經(jīng)系統[AnnuRev Neurosci，IF=12.4]、前額葉皮層[Nat Neurosci，IF=24.9]、海馬和前額葉皮質(zhì)[NatureCommunications，IF=14.9]等都組織區域都有不錯的研究報道，甚至連取材最困難的皮膚樣本都發(fā)表重要研究成果：皮膚肉芽腫[Nature Immunology ，IF=25.6]，空間轉錄組逐漸在更多的組織類(lèi)型上得到廣泛的應用，揭示更深層次空間維度生物學(xué)表型。
空間轉錄組不同組織應用發(fā)表文獻統計
基于上面數據我們不難看出來(lái)前期研究，腦組織空間基因表達探索最為廣泛，當然還有心臟組織、肝組織前列腺組織；植物主要集中在花序器官的研究，隨著(zhù)各種組織探索和嘗試，基本上空間轉錄組已經(jīng)在各種組織中全面開(kāi)火，不管從技術(shù)的前瞻性也好，還是從空間這個(gè)維度深度闡釋一些生物學(xué)現象，彌補了細胞空間位置信息的趨勢，空間多組學(xué)技術(shù)毫無(wú)疑問(wèn)成為引領(lǐng)科學(xué)研究的風(fēng)向標。
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2021年度空間轉錄組動(dòng)植物四大應用方向：時(shí)空圖譜篇（發(fā)育）、腫瘤篇、疾病機制篇、生物進(jìn)化篇
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