CircRNA是真核生物中共價(jià)封閉的內源性生物分子，具有組織特異性和細胞特異性的表達特點(diǎn)。其來(lái)源方式多樣，不易受RNA外切酶影響,表達更穩定,不易降解，許多circRNA可通過(guò)充當microRNA的“海綿”或某些蛋白質(zhì)的抑制劑，從而阻斷miRNA對靶基因的抑制作用，同時(shí)調控其他類(lèi)型RNA的表達，circRNA一直是科研人員關(guān)注的熱點(diǎn)研究之一，并且隨著(zhù)CircRNA的編碼能力的發(fā)現，circRNA的研究更是吸引了大家的目光。
近期，Nature發(fā)表了一篇關(guān)于真核生物中的CircRNA研究發(fā)展的評論（Widespread occurrence of circular RNA in eukaryotes），文章中介紹了從在20世紀70年代末到當前CircRNA的主要發(fā)展節點(diǎn)，從80年代，CircRNAs被認為起源于RNAs的副產(chǎn)物，到2013年，《自然》雜志同一期的兩篇文章報道了真核生物中數千個(gè)含有外顯子序列的CircRNAs，再到Memczak和Rajewsky等人的論文揭示了CircRNA參與的復雜調控網(wǎng)絡(luò )，CircRNA的研究一直在如火如荼的進(jìn)行中。據不完全統計，僅2020年已發(fā)表的circRNA相關(guān)文章，影響因子大于10的文章有99篇，5~10的文章有324篇，小于5的文章1468篇！特別是影響因子>10的CircRNA文章數量相比之前的五年有明顯增長(cháng)。
百邁客生物作為國內轉錄組學(xué)研究的先行者，不僅對于線(xiàn)性RNA的研究經(jīng)驗豐富，在非編碼RNA的研究方向上也身經(jīng)百戰，涉及覆蓋動(dòng)物、植物、真菌等近百個(gè)物種類(lèi)型，為了方便客戶(hù)的數據挖掘，同時(shí)也配備了專(zhuān)業(yè)完善的分析平臺，今天就要向各位宣布一個(gè)好消息，CircRNA的個(gè)性化上線(xiàn)啦！
一、基因查找不費勁
CircRNA的功能分析主要依靠于來(lái)源基因的功能注釋?zhuān)绾卧诤Ａ康臄祿兄苯诱业疥P(guān)心的目的基因呢?首先就是根據功能注釋進(jìn)行檢索，百邁客云平臺的CircRNA分析平臺中，支持針對結果根據八大功能數據庫的注釋信息批量檢索相關(guān)注釋基因、并且批量提取相關(guān)信息；靶向關(guān)系的預測也是關(guān)鍵circRNA檢索的必要一步，CircRNA分析平臺同時(shí)支持通過(guò)miRNA的ID批量提取相關(guān)靶向的CircRNA信息，此外，CircRNA ID、來(lái)源基因ID、來(lái)源基因name等功能，通過(guò)上傳ID文件均可實(shí)現批量查詢(xún)，甚至可以批量下載序列文件，省去多個(gè)文件來(lái)回切換的繁雜操作，一鍵式提取關(guān)鍵信息！
二、功能注釋富集分析信手拈來(lái)
CircRNA的調控作用深度挖掘離不開(kāi)功能富集分析，研究角度的多樣、篩選條件的調整直接導致圖形繪制的重復工作量，為了讓老師們不再為美觀(guān)多樣的富集圖繪制而感到頭禿，CircRNA云平臺支持多種富集圖在線(xiàn)繪制，無(wú)需整理復雜多樣的輸入文件，無(wú)需學(xué)習晦澀難懂的生信語(yǔ)言，無(wú)論怎么調整基因集合，只需要一個(gè)點(diǎn)擊，美觀(guān)準確的八大類(lèi)型富集圖即刻獲得?。ㄅ浜匣蚝Y選功能使用更佳哦~）
三、差異參數任性調整
對于需要通過(guò)結果分析挑選關(guān)鍵基因的研究方向來(lái)說(shuō)，選擇合適的差異篩選條件對于基因的選擇是事半功倍的，但是往往合適的篩選條件需要多次的調整摸索，這時(shí)差異篩選條件的調整功能顯得尤為重要，CircRNA云平臺同樣支持在線(xiàn)完成差異參數的調整，基因數目太少、差異軟件不合適、參數設置不合理等問(wèn)題，通通可以調整！不限次、不限時(shí)，只需簡(jiǎn)單的點(diǎn)擊，輕松完成！
四、多個(gè)分組輕松比較
單一變量下的差異比較組結果往往無(wú)法證明相應結論，所以往往會(huì )設置多個(gè)比較組，當有多個(gè)差異比較組時(shí)，如何輕松篩選在各個(gè)集合間不同表達模式的基因顯得尤為重要，此時(shí)，韋恩圖扮演了重要的角色，通過(guò)不同比較組基因集合的韋恩圖，我們可以輕松獲得在任意比較組中特意表達或者在各個(gè)組合中共同表達的基因集合，CircRNA分析平臺分別配有基因表達韋恩圖（篩選不同樣本中特有或者共有表達基因集）以及差異表達韋恩圖（篩選不同差異分組中特有或者共有表達基因集），進(jìn)一步配合上下調基因的篩選，輕松找出有連續變化模式的基因集（這些基因可能是性狀相關(guān)的關(guān)鍵基因哦~
五、共表達分析助力數據挖掘
共表達分析常用于識別差異表達基因的共表達模式，分析各樣品間CircRNA表達豐度的不同變化模式，將相同表達趨勢的CircRNA劃分為一個(gè)數據集，通常我們認為，具有相同表達變化趨勢的基因的功能互有關(guān)聯(lián)，所以通過(guò)分析CircRNA的共表達趨勢分析，可以進(jìn)一步篩選出項目中關(guān)鍵的基因集合。CircRNA分析平臺搭載了共表達分析個(gè)性化，簡(jiǎn)單的選擇基因集合以及樣本即可完成分析。
百邁客云平臺搭載的個(gè)性化功能，無(wú)需整理復雜的輸入文件、無(wú)需掌握晦澀的生信語(yǔ)言、不受時(shí)間空間的限制，只要有互聯(lián)網(wǎng)的地方，全年365天，全天24小時(shí)均能開(kāi)展數據挖掘，任何您靈感迸發(fā)的瞬間，都可以登陸平臺完成分析！目前轉錄調控全線(xiàn)全產(chǎn)品均已上云，完善的云服務(wù)模式深度助力提升客戶(hù)體驗，更多好用的功能期待您的體驗！
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