遺傳進(jìn)化分析方法和軟件培訓班

想系統學(xué)習遺傳進(jìn)化常規分析怎么做？想定制化繪制優(yōu)美的圖形？想了解遺傳進(jìn)化在文章中的應用？

這是你嗎？

應各位老師需求，百邁客特開(kāi)辦遺傳進(jìn)化生信分析培訓班，面向全體科研工作者，系統學(xué)習遺傳進(jìn)化中常規內容，并重點(diǎn)進(jìn)行高級圖形繪制。課程設計覆蓋基因流、分化時(shí)間、群體歷史動(dòng)分析三塊當前熱點(diǎn)研究?jì)热荨?/p>

課程亮點(diǎn)：

1、定制化繪制各種優(yōu)美漂亮圖片

2、豐富齊全的學(xué)習文檔，每一步驟每一代碼詳細列出

3、課上課下均可獨立操作的專(zhuān)門(mén)服務(wù)器

4、理論與實(shí)操相結合，系統學(xué)習遺傳進(jìn)化課程

5、免費且長(cháng)期的售后答疑群，保障學(xué)員課下學(xué)習

6、講師團隊專(zhuān)注于動(dòng)植物領(lǐng)域5年以上，具有豐富的項目經(jīng)驗和培訓經(jīng)驗

為了讓大家更系統了解本次課程的相關(guān)培訓，現將部分教授內容展示如下：

系統發(fā)育樹(shù)：

又稱(chēng)系統發(fā)生樹(shù)、系統演化樹(shù)、種系發(fā)生樹(shù)等。表明被認為具有共同祖先的各物種之間的演化關(guān)系樹(shù)形圖，用來(lái)描述物種之間的分類(lèi)和演化關(guān)系。本課程帶領(lǐng)學(xué)員學(xué)習系統發(fā)育樹(shù)發(fā)展、相關(guān)術(shù)語(yǔ)、系統發(fā)育樹(shù)分類(lèi)以及建樹(shù)步驟，同是針對分析結果進(jìn)行圖形化繪制，如下圖。

群體結構：

群體結構，又稱(chēng)群體分層，指所研究的群體中存在基因頻率不同的亞群。群體結構分析有助于理解進(jìn)化過(guò)程，并且可以通過(guò)基因型和表型的關(guān)聯(lián)研究確定個(gè)體所屬的亞群。本次課程帶領(lǐng)學(xué)員學(xué)習structure和admixture兩款軟件，基于deltak和CV值法進(jìn)行分群，并定制化繪制群體結構圖形（分組和不分組、色系調整等）。

群體結構和系統發(fā)育樹(shù)組合圖：

主成分分析：

設法將原來(lái)眾多的具有一定相關(guān)性的變量(標記)重新組合成一組較少個(gè)數的互不相關(guān)的綜合變量(主成分)。主成分分析主要應用：群體分層、outlier篩選、亞群進(jìn)化關(guān)系、群體結構矯正。本次課程利用smartpca軟件進(jìn)行實(shí)際操作，掌握二維圖和三維圖繪制。

選擇清除分析：

自然選擇促使有利突變在群體中保留下來(lái)，與之連鎖的中性位點(diǎn)突變頻率提升，非連鎖的中性位點(diǎn)突變頻率下降；簡(jiǎn)單的說(shuō)就是基因組某區域由于受到了選擇而消除多態(tài)性，即遺傳多樣性降低，在群體中出現高頻的等位基因和低頻的等位基因。
針對這塊生信領(lǐng)域熱點(diǎn)研究?jì)热?，本次課程主要介紹PopGenome、vcftools兩款軟件，針對θπ、θw、Fst、Tajima’s D等各種指標進(jìn)行分析并圖示化結果。

除了遺傳進(jìn)化常規分析內容之外，本次課程涵蓋分化時(shí)間、基因流、群體歷史動(dòng)態(tài)三塊高級分析內容。部分結果展示如下：

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課程內容列表

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