
學(xué)術(shù)交流
德國萊布尼茨植物遺傳與作物研究所Nils Stein研究員?講述了自2012年第一個(gè)大麥基因發(fā)表以來(lái),染色體水平大麥及中國春小麥等麥類(lèi)基因組研究的發(fā)展歷程。介紹了大麥遺傳多樣性與地理起源,并講述了大麥泛基因組相關(guān)研究。最后Nils教授表示泛基因組研究在基因挖掘、育種和變異等方面研究具有重要意義。
Nils Stein研究員報告
河南農業(yè)大學(xué)王道文研究員詳述了黑麥具有較大的基因組特征(~7 – 8 Gb),其抗寒、抗病、抗逆和耐旱等多種優(yōu)良的特性對谷物研究和生產(chǎn)帶來(lái)了巨大貢獻。并對黑麥染色體的進(jìn)化,特別是與水稻、小麥、大麥的染色體的結合進(jìn)行了闡述。介紹了中國黑麥細胞遺傳學(xué)和育種研究相關(guān)進(jìn)程與成果。表示黑麥泛基因組研究將擴大對黑麥基因組多樣性的了解,促進(jìn)黑麥、小黑麥和小麥的更有效改良。最后王道文研究員表示基因組學(xué)知識和基因組學(xué)工具正在給作物改良帶來(lái)新一輪的綠色革命。
王道文研究員報告
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德國萊布尼茨植物遺傳與作物研究所Timothy Rabanus-Wallace 博士講述了黑麥基因組破譯所面臨的挑戰,并細致全面的講述了本次研究聯(lián)合短讀長(cháng)、Hi-C、10×Genomics、遺傳圖譜及光學(xué)圖譜等技術(shù)如何破譯歐洲栽培黑麥“Lo7”基因組。解析了黑麥基因間空間的演化,以及抗病、抗寒與自交不親和等生物學(xué)過(guò)程的發(fā)生與作用機制,揭示了黑麥易位染色體片段對小麥遺傳改良的重要作用。Timothy 博士表示,未來(lái)可以基于品種間Hi-C基因組定位,在威寧黑麥和Lo7基因組間進(jìn)行系統的結構比較,研究不同品系黑麥基因組間的大片段結構變異。
Timothy Rabanus-Wallace 博士報告
河南農業(yè)大學(xué)李廣偉博士系統解析了黑麥的演化歷史,展示了黑麥的分類(lèi)起源和世界遺傳資源分布,并表示黑麥作為全球麥類(lèi)基因資源具有重要的研究意義。通過(guò)中國栽培種“威寧黑麥”基因組的高質(zhì)量精細物理圖譜的構建,展示了其復雜的基因組特征、復雜的染色體變異以及淀粉合成、儲存蛋白、抽穗期及馴化等相關(guān)基因的詳細機制。最后李廣偉博士表示威寧黑麥基因組的破譯對深化比較谷類(lèi)基因組研究,加速黑麥及相關(guān)谷類(lèi)作物的遺傳改良具有重要價(jià)值。
李廣偉博士報告
北京百邁客生物科技有限公司李緒明 展示了現在基因組研究中運用的主流測序技術(shù)原理及各自特征。并通過(guò)麥類(lèi)基因組發(fā)表歷程及百邁客實(shí)際項目產(chǎn)出情況,系統了講述了PacBio與Nanopore平臺各自特點(diǎn)。同時(shí)也展示了高雜合、高重復、染色體條數繁多等問(wèn)題對基因組研究帶來(lái)的巨大挑戰,以及本次威寧黑麥基因組在面對這些挑戰時(shí)所做出的積極應對方案。提出了目前主流的基因組測序方案與組裝流程,并通過(guò)多個(gè)復雜的基因組項目案例展示了百邁客在基因組組裝上的超高水平。最后李緒明對基因組組裝技術(shù)的革新以及未來(lái)完整基因組的面世做出了展望。
李緒明先生報告
在濃厚的學(xué)術(shù)氛圍下,“黑麥科研合作成果NG論文國際學(xué)術(shù)交流會(huì )”成功落下了帷幕!通過(guò)這次交流會(huì ),充分展示了麥類(lèi)基因組學(xué)研究領(lǐng)域的重大進(jìn)展,加強了行業(yè)信息與資源的共享,共同促進(jìn)農業(yè)科學(xué)發(fā)展,將對我國功能基因組學(xué)研究的深入和發(fā)展起到推動(dòng)作用。
詳細文獻解讀可點(diǎn)擊:百邁客合作||Nature Genetics高質(zhì)量黑麥基因組揭示重要的農藝基因
百邁客生物科技有限公司(Biomarker Technologies)成立于2009年5月,是一家高新技術(shù)企業(yè),公司基于功能基因組學(xué)的BT+IT(高通量基因測序技術(shù)、生物信息技術(shù)、高性能生物云計算技術(shù))技術(shù),面向廣大科研工作者提供以綜合科技服務(wù)、BMKCloud生物云分析、二代及三代高通量測序分析,儀器,試劑等為主的科技服務(wù)。公司目前擁有Nanopore、Pacbio、Illumina、Waters、10X genomics等主流服務(wù)平臺,構建了基于云架構的自主生物云計算分析平臺—百邁客云,提供涵蓋人重外顯子、三維基因組、單細胞與空間轉錄組、基因組de novo、轉錄調控、微生物、群體遺傳、質(zhì)譜及表觀(guān)遺傳等研究方向的技術(shù)服務(wù)。自公司成立起,服務(wù)客戶(hù)在《Cell》、《Nature》、《Nature Genetics》、《Nature Communications》、《Plant Cell》、《PNAS》等學(xué)術(shù)刊物發(fā)表論文數千篇。