物種數據庫幫您更快發(fā)表高分文章！

百邁客物種數據庫是一個(gè)將多組學(xué)數據高度整合、集成在一起，實(shí)現數據的瀏覽、查詢(xún)、再度挖掘的綜合性平臺。

為了更好的服務(wù)于科研，物種數據庫推出了V2.0版：不但可共享研究成果，而且通過(guò)后臺管理系統可以完成logo、文字描述、配色、單位等信息的修改，更重要的是可以實(shí)現新增數據的一鍵式部署。

更更重要的是，數據庫也可以發(fā)表高分文章哦！

百邁客物種數據庫核心功能介紹

標準版數據庫：http://bio-db-demo.biocloud.net/home

• Browse

標準版Browse模塊中共部署了7個(gè)子模塊進(jìn)行核心數據的瀏覽，如Browse中的Annotation模塊，鏈接：http://tomato.biocloud.net/page/browse/Annotation

功能說(shuō)明：

• 選擇物種
• 選擇所關(guān)心的注釋數據庫類(lèi)型（默認是All）
• 輸入所關(guān)心的基因ID或者功能注釋關(guān)鍵字

• Search

標準版Search模塊中共部署了5個(gè)子模塊完成數據的查詢(xún)、檢索，如Search模塊中的Multicriteria Search，

鏈接：http://bio-db-demo.biocloud.net/page/search/multicriteriaSearch

功能說(shuō)明：

• 選擇待檢索的變異類(lèi)型，SNP ?或者 Indel
• 選擇在哪個(gè)版本的參考基因組中檢索結果
• 輸入檢索的染色體區域
• 輸入要檢索的基因ID
• 輸入要檢索的變異ID

注 3、4、5三個(gè)選項只能選擇一個(gè)哦！

• 選擇要在哪個(gè)品種中進(jìn)行檢索
• 具體要檢索的Type類(lèi)型
• 具體要檢索的基因型Genotype

點(diǎn)擊Search后，即可完成特定樣品在特定條件下的變異詳情信息了，結果中還包括了變異位點(diǎn)上下游20bp、及500bp的序列信息，便于用戶(hù)進(jìn)行引物設計。

• Tools

標準版Tools模塊中共部署了8款工具用于對庫中多組學(xué)數據的進(jìn)一步深度挖掘：

• 基于局部比對算法的搜索工具：Blast、Blat
• 基因組瀏覽器：Gbrowse、Jbrowse，用來(lái)展示各種基因信息，比如基因的外顯子內含子，比如轉座子和重復序列或者SNP/Indel
• 計算個(gè)體表型數據的工具：TRAIT
• 基因共表達網(wǎng)絡(luò )圖：Gene network
• 引物設計軟件：Primer Design
• 基因表達量熱圖：Expression Visualization

如Tools模塊中的Expression Visualization，

鏈接：http://bio-db-demo.biocloud.net/page/tools/expressionVisualization

功能說(shuō)明：

• 輸入關(guān)心的基因ID，基因ID之前以逗號分隔
• 選擇特定個(gè)體、特定組織在特定處理條件下的樣品

點(diǎn)擊“Display Expression Heatmap”即可構建出表達量熱圖

• 后臺管理

通過(guò)管理員賬號登錄后臺后，不但可以編輯背景色、輪播圖、各個(gè)模塊的文字描述，而且底層數據也可以通過(guò)后臺進(jìn)行上傳、管理。

再也不需要占用一個(gè)被灰塵落滿(mǎn)的硬盤(pán)存儲科研數據了；

再也不需要配備專(zhuān)業(yè)的美工去完成頁(yè)面背景色的修改了；

再也不需要哀求專(zhuān)業(yè)的IT開(kāi)發(fā)工程師、運維工程師去完成底層數據的更新了（替換、追加隨您便）；

背景色的編輯：

Home頁(yè)內容編輯：

我們通過(guò)上面4部分內容，對百邁客物種數據庫的功能做了一個(gè)簡(jiǎn)單的介紹。

如果想了解更多的功能，

如果想了解更多的后臺管理功能

如果您想為您的科研數據部署一個(gè)數據庫

請通過(guò)網(wǎng)站查看–http://bio-db-demo.biocloud.net/home

 

成功案例：

蝦數據庫：http://shrimp.biocloud.net

番茄數據庫：http://tomato.biocloud.net