本期分享文獻
文章題目:Evaluation of Sample Preservation Approaches for Better Insect Microbiome Research According to Next-Generation?and Third-Generation Sequencing
發(fā)表期刊:《Microbial Ecology》
發(fā)表時(shí)間:2021年3月
影響因子:4.55
第一作者:楊子文 中山大學(xué)
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昆蟲(chóng)的共生微生物參與了寄主生存與適應的諸多重要環(huán)節,包括消化、營(yíng)養和防御等,時(shí)常發(fā)揮著(zhù)關(guān)鍵的作用,因此也被視為推動(dòng)昆蟲(chóng)快速演化的關(guān)鍵因素之一。隨著(zhù)對于昆蟲(chóng)共生微生物的研究從模式生物和經(jīng)濟類(lèi)群逐漸拓展到更大多樣性規模的昆蟲(chóng)物種,如何在長(cháng)時(shí)間的野外采集工作中高質(zhì)量地保存樣品,也成為后續研究中需要有效應對的一項挑戰。
本文對昆蟲(chóng)樣品野外保藏的四種常見(jiàn)方法進(jìn)行了評估,并分別采用了二代測序技術(shù)以及三代測序技術(shù)對平行數據進(jìn)行分析。2021年3月11日,研究成果以“Evaluation of Sample Preservation Approaches for Better Insect Microbiome Research According to Next-Generation and Third-Generation Sequencing”為題,發(fā)表在學(xué)術(shù)期刊《MICROBIAL ECOLOGY》上。
本期文獻秀邀請了本文第一作者楊子文博士為大家帶來(lái)該科研項目的研究經(jīng)歷。
活動(dòng)信息
時(shí)間:8月13日 16:00
形式:免費線(xiàn)上直播
本期分享嘉賓
楊子文 博士
中山大學(xué)生態(tài)學(xué)專(zhuān)業(yè),獲得南京大學(xué)學(xué)士學(xué)位以及中山大學(xué)碩士學(xué)位。研究方向為利用組學(xué)技術(shù)以及生物信息學(xué)研究蝽類(lèi)昆蟲(chóng)與微生物共生關(guān)系的演化。
李漢洲 產(chǎn)品經(jīng)理
畢業(yè)于哈爾濱醫科大學(xué)生物信息科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,具有6年微生物組學(xué)研究經(jīng)驗,現任百邁客微生物產(chǎn)品經(jīng)理。
分享主題
時(shí)間 | 主題 |
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16:00-16:40 | 楊子文:基于二代以及三代測序技術(shù)對常用昆蟲(chóng)共生微生物樣品保存方法的評估 |
16:40-17:20 | 李漢洲:Pacbio測序技術(shù)在微生物多樣性研究中的優(yōu)勢 |
17:20-17:30 | 討論環(huán)節 |
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