NC|單細胞microRNA-mRNA共測序

 

下載英文文獻全文<

從相同的單個(gè)細胞中測定多組學(xué)譜可以解析發(fā)育和疾病中細胞間異質(zhì)性的分子調控機制。本研究使用半細胞基因組學(xué)方法（“half-cell genomics approach”），在同一單細胞中實(shí)現microRNA和mRNA的共同單細胞測序。

a 基于半細胞的單細胞miRNA-mRNA共測序的實(shí)驗流程; b 單獨的scmiRNA-seq流程；c 單獨的scRNA-seq流程

盡管已經(jīng)開(kāi)發(fā)出單細胞組學(xué)技術(shù)，通過(guò)比較單個(gè)細胞和大量混合細胞之間的可測量的分子表達譜來(lái)量化細胞間異質(zhì)性，但要確定這些變異性是真正的生物異質(zhì)性還是單細胞測序中技術(shù)噪聲造成的仍然具有挑戰性。解決這個(gè)問(wèn)題的最佳實(shí)驗是測量從同一個(gè)單細胞均勻分開(kāi)的兩個(gè)半細胞材料之間的變異性。

1、作者首先分別比較了來(lái)自同一細胞的半細胞單細胞microRNA測序和單細胞轉錄組測序之間的差異：該方法表現出良好的穩健性（~95％成功率）和重現性（microRNA和mRNA的R²=0.93），產(chǎn)生可獨立驗證的成對半細胞microRNA和mRNA表達譜。

2、通過(guò)將miRNA水平與19個(gè)表型相同的單細胞中預測的靶mRNA的表達關(guān)聯(lián)起來(lái)，觀(guān)察到預測的靶標與大量表達的miRNA變化顯著(zhù)負相關(guān)。表明單獨的microRNA表達變異性可能導致非遺傳性細胞間異質(zhì)性。

 

如果您在科研的過(guò)程中有問(wèn)題，歡迎點(diǎn)擊下方按鈕咨詢(xún)我們，我們將免費為您設計文章設計方案。