三代微生物多樣性是基于?PacBio?測序平臺，利用單分子實(shí)時(shí)測序（SMRT Cell）的方法，基于HIFI模式對對單一片段進(jìn)行多輪測序，在確保測序片段的長(cháng)度的同時(shí)，也確保了單一片段測序數據的準確性?；谄涑L(cháng)讀長(cháng)的特點(diǎn)，可直接獲得全部變異區序列信息，獲得到“種”的分類(lèi)鑒定，從而更加真實(shí)地還原樣本中微生物的群落結構。
經(jīng)過(guò)不斷的經(jīng)驗積累，百邁客目前已擁有3500+項目交付，80000+樣本測序經(jīng)驗，研究成果涵蓋土壤，淤泥，根際，水體，深海冷泉，沉積物，反應器，發(fā)酵體系，腸道，糞便等多種組織類(lèi)型，平均單篇影響因子8分以上，助力客戶(hù)進(jìn)入精細微生物組研究時(shí)代。下面我們一起來(lái)看下文章案例思路~
客戶(hù)案例一：全長(cháng)微生物多樣性（細菌全長(cháng) 16S）+ 細菌框架圖助力客戶(hù)解析油茶根內生菌Streptomyces sp. CoT10的磷周轉機制和促進(jìn)植物根際調節。
文章題目：Siderophores, a potential phosphate solubilizer from the endophyte Streptomyces sp. CoT10, improved phosphorus mobilization for host plant growth and rhizosphere modulation
期刊名稱(chēng)：Journal of Cleaner Production
影響因子：11.072
發(fā)表時(shí)間：2022年7月
合作單位：湖南大學(xué)
研究?jì)热荩?/strong>土壤中的可用磷（AP）缺乏是農業(yè)和林業(yè)生產(chǎn)中的一個(gè)重要限制因素。因此，具有高磷動(dòng)員能力的微生物是非常值得關(guān)注的，特別是在酸性土壤中，大部分P被Fe固定。油茶是一種典型的酸性土壤種植油料作物，在我國林業(yè)經(jīng)濟體系中具有較高的地位。在這項研究中，作者從油茶內生菌中篩選并鑒定了鏈霉菌株CoT10。CoT10可以有效地調動(dòng)不同的P資源，特別是對FePO4表現出高溶解度，并在生產(chǎn)不同的副產(chǎn)物方面表現突出。接種CoT10改善了土壤微生物多樣性，放線(xiàn)菌、變形菌、厚壁菌等優(yōu)勢群的比例明顯增多。此外，冗余分析（RDA）、網(wǎng)絡(luò )分析和功能預測表明，接種CoT10改善了油茶根際土壤中的微生物相互作用，平衡了土壤微生物P和Fe相關(guān)的功能作用。CoT10及其鐵載體為調節富鐵土壤中磷的遷移提供了一種有價(jià)值的方法，以促進(jìn)植物相關(guān)產(chǎn)業(yè)的可持續和生態(tài)友好型發(fā)展。
客戶(hù)案例二：全長(cháng)微生物多樣性（細菌全長(cháng) 16S）+ 代謝組聯(lián)合分析助力客戶(hù)定向分離能夠增強海稻耐鹽性的根際植物生長(cháng)促進(jìn)菌。
文章題目：Microbiome-metabolome analysis directed isolation of rhizobacteria capable of enhancing salt tolerance of Sea Rice 86
期刊名稱(chēng)：Science of The Total Environment
影響因子：10.753
發(fā)表時(shí)間：2022年6月
合作單位：廣東海洋大學(xué)
研究?jì)热荩?/strong>土壤鹽堿化被認為是導致耕地面積和全球植物生產(chǎn)力減少的主要因素之一。應用耐鹽植物和提高植物耐鹽性被認為是鹽漬土恢復和利用的主要途徑。海稻86（SR86）被稱(chēng)為能夠在鹽堿土壤中生長(cháng)的水稻品種，本研究以SR86幼苗不同鹽度下根際細菌多樣性和土壤代謝組為研究對象，了解其對植物耐鹽性的貢獻。研究發(fā)現鹽脅迫可以顯著(zhù)改變根際細菌多樣性和根際代謝物。通過(guò)共生分析確定了關(guān)鍵分類(lèi)群，關(guān)鍵分類(lèi)群與根際代謝物之間的相關(guān)性分析表明，脂類(lèi)及其衍生物可能在植物耐鹽性中發(fā)揮重要作用。此外，進(jìn)一步分離出了四種能夠促進(jìn)SR86耐鹽的植物生長(cháng)促進(jìn)菌（PGPR），并對其進(jìn)行了表征。研究結果可為植物-微生物相互作用介導的植物耐鹽機制提供新的思路，促進(jìn)PGPR在鹽漬土恢復利用中的分離和應用。
客戶(hù)案例三：全長(cháng)微生物多樣性（細菌全長(cháng) 16S ?+ 古菌全長(cháng) 16S）+ 宏基因組助力客戶(hù)探索嗜化原核生物如何驅動(dòng)中國南海絕跡冷泉的碳、硫、氮循環(huán)。
文章題目：Riddles of Lost City: Chemotrophic Prokaryotes Drives Carbon, Sulfur, and Nitrogen Cycling at an Extinct Cold Seep, South China Sea
期刊名稱(chēng)：Microbiology spectrum
影響因子：?9.043
發(fā)表時(shí)間：2022年12月
客戶(hù)單位：中國科學(xué)院南海海洋研究所
研究?jì)热荩?/strong>深海冷泉是由流體攜帶的碳氫化合物維持生產(chǎn)力的生態(tài)系統之一。一旦流體停止，繁榮的自養群落就會(huì )消亡，被稱(chēng)為絕跡冷泉。但異養生物群甚至可以存活數千年。原核生物在活躍冷泉中的關(guān)鍵作用已明確，但迄今為止人們對它們在絕跡冷泉中的功能知之甚少。此研究闡明了南海海馬冷泉已絕跡冷泉地點(diǎn)沉積物原核生物的多樣性、分類(lèi)特異性、種間相關(guān)性和代謝特征。與活躍冷泉相比，已絕跡冷泉的古菌α多樣性顯著(zhù)增加，而細菌的α多樣性保持不變。然而，基于加權層面，古菌組成在活躍或非活躍位點(diǎn)的絕跡冷泉處沒(méi)有顯著(zhù)差異，而細菌組成表現出顯著(zhù)差異。古菌和細菌的分布在已絕跡的冷泉中表現出明顯的特異性，表明了這里獨特的生命特征。原核生物可能在無(wú)機碳、硫和氮的循環(huán)中以化學(xué)自養方式生活，或在碳氫化合物的循環(huán)中以化學(xué)有機體營(yíng)養的方式生活。值得注意的是，許多已絕跡的冷泉特定物種和網(wǎng)絡(luò )的關(guān)鍵譜系被歸類(lèi)為變形桿菌。關(guān)于該分支的功能多樣性和代謝靈活性，變形桿菌被認為整合了地球化學(xué)循環(huán)，并在絕跡冷泉微生物組的能量和資源補充中發(fā)揮關(guān)鍵作用?？偟膩?lái)說(shuō)，研究結果揭示了已絕跡冷泉中的微生物生態(tài)學(xué)和功能多樣性，為流體停止后的生物地球化學(xué)循環(huán)提供了新的理解。
情人節福利來(lái)襲~
為感謝各位老師一直以來(lái)的支持，百邁客特推出?“極速周期” 以助力科研基金申請，對于著(zhù)急出結果的老師，本月底前到樣的項目均可享受 “極速周期”服務(wù)?。。?！
京公網(wǎng)安備 11011302003368號