注: 任務(wù)不要重復多次提交,一次建議只運行一個(gè)主流程任務(wù),多任務(wù)并行會(huì )導致卡頓,以至運行失敗。一般正常任務(wù) 一天之內能夠分析完成,如一天之后還沒(méi)運行完成,可能就是任務(wù)失敗了,需要聯(lián)系后臺人員查看報錯原因處理。
]]>進(jìn)入項目管理 – 我的項目 – 打開(kāi)對應的項目
上述報告查找頁(yè)面 – 打開(kāi)報告之后 – 點(diǎn)擊報告右上角 – 項目結果下載 – 選擇下載結果數據
結果數據較小的直接使用瀏覽器下載,較大的需要使用 ftp 下載,具體的 ftp下載指導在后續詳細介紹。
我們對于不同的產(chǎn)品對應了不同的編號加以區分,詳細如下:
報告/任務(wù)編號對應產(chǎn)品類(lèi)型:
微生物多樣性:microbial_年月日編號
微生物多樣性更新報告:Microbial_updateReport_年月日編號
無(wú)宿主宏基因組:MetaG_年月日編號
有宿主宏基因組:MetaG_宿主拉丁名_年月日編號
宏基因組更新報告:metag_updateReport_年月日編號
微生物基因組:MicroG_年月日編號數據下載:上述報告查找頁(yè)面 – 點(diǎn)擊左側數據 – 進(jìn)入相應數據文件夾
進(jìn)入 microbial_*(或者其他產(chǎn)品類(lèi)型對應的編號)對應的文件夾下 – 打開(kāi)Needed_Data 文件夾,具體需要下載的文件如下:
打開(kāi)原始數據文件夾
目前平臺不支持文件夾下載,所以需要打開(kāi)相應文件夾,全選數據后進(jìn)行打包下載。
FTP 下載指導:下載方式選擇 FTP 下載,平臺會(huì )將具體的操作步驟發(fā)到注冊郵箱賬號中,也會(huì )發(fā)到個(gè)人中心信息中,如下:
打開(kāi) FTP 客戶(hù)端:依次填寫(xiě)好上述主機,用戶(hù)名,密碼,端口信息,打開(kāi)之后選擇最新的文件夾,里面就是剛剛選中打包下載的數據,然后直接選中數據,拖拽到左邊目標文件夾中即可。
建庫測序分析產(chǎn)品以結題報告的形式交給老師,報告中的分組以老師提供的分析方案為準。老師們在拿到結果后,可能會(huì )有更改樣本名、重新分組、變更聚類(lèi)參數、與其他同類(lèi)型項目合并分析等需求。其中,更改樣本名、重新分組、過(guò)濾物種或抽平可以通過(guò)更新結題報告實(shí)現(見(jiàn)更新結題報告操作指導),而改變質(zhì)控參數、添加更多樣本則需要重新投遞主流程(見(jiàn) APP 主流程投遞操作指導)。
由于原始數據為線(xiàn)下交付,不再自動(dòng)備份至云平臺,因此投遞主流程需要老師先將原始數據上傳至云平臺。本指導即為針對此需求撰寫(xiě)的云平臺操作指南。
另:主流程分析權限(標準套餐)每項目一年售后期內可以免費開(kāi)通 3 次,一次 10天,在權限時(shí)間內沒(méi)有分析次數限制,但是一次只能投遞一個(gè)任務(wù)。
1、登陸賬號后,在主頁(yè)面查看項目管理,進(jìn)入“我的數據”
2、在我的數據中,建議新建文件夾后,進(jìn)入新文件夾,點(diǎn)擊“上傳”,選擇上傳文件或 FTP 上傳。
上傳文件:選 擇 文 件 上 傳 , 點(diǎn) 擊 “ 上 傳 ” , 選 擇 下 載 好 的 原 始 數 據(\Needed_Data\Rawdata\01.Rawdata 路徑下的所有文件),點(diǎn)擊確定即可等待數據上傳完成。
網(wǎng)頁(yè)只能上傳 200MB 以下的數據,上傳更大的數據請點(diǎn)擊”FTP 上傳”。注:不支持上傳 0 字節文件!文件名不能包含中文及特殊字符!
FTP 上傳:數據量大于 200M 時(shí)使用 FTP 上傳數據。選擇“FTP 上傳”后彈出提示對話(huà)框,點(diǎn)擊“確定”后系統會(huì )自動(dòng)創(chuàng )建一次性的 FTP 賬戶(hù),用于本次數據上傳。賬戶(hù)信息會(huì )發(fā)送至注冊郵箱及平臺的“個(gè)人中心——消息中心”中。依照提示操作即可。
注:數據上傳完成后需要通過(guò)中轉站中轉,不會(huì )立刻顯示在平臺中。具體時(shí)間視數據量而定,最久約半天時(shí)間,若仍找不到數據請聯(lián)系售后人員處理。
1、私有云平臺主頁(yè)
2、分析平臺參數頁(yè)面
3、在線(xiàn)查看分析報告
4、個(gè)性化分析功能展示
為滿(mǎn)足中小課題組的生信分析需求,百邁客推出輕量版私有云:將生信分析平臺部署在一臺高性能工作站上,實(shí)現開(kāi)箱即用,作為百邁客私有云的有力補充。
為解決大家在Linux操作系統中,安裝和使用生信軟件時(shí)遇到的種種問(wèn)題,百邁客全面升級了專(zhuān)用機搭載的軟件功能,我們的優(yōu)勢:
1)硬件:根據用戶(hù)的計算需求,我們可以提供從工作站到機架式服務(wù)器的各種硬件配置,且可以根據您的計算類(lèi)型,合理配置CPU數目和內存大小,實(shí)現硬件資源的組合。
2)軟件:根據用戶(hù)需求我們提供了常用生信軟件,并封裝和串聯(lián)成常用分析模塊,通過(guò)單行命令即可完成很多常規分析內容,如基因表達量計算、突變檢測、基因功能注釋等。
部分可部署生信模塊如下:
三大產(chǎn)品形態(tài),覆蓋生信數據分析場(chǎng)景,
總有一款適合您!